在修订版中，金庸首先对黄药师的出身进行了加工：
师父是浙江世家，书香门第，祖上在太祖皇帝时立有大功，一直封侯封公……太师祖忠心耿耿，在朝廷外大声疾呼，叫百官与众百姓大伙儿起来保岳飞。秦桧便将太师祖杀了，家属都充军去云南。师父是在云南丽江出生的。他从小就读了很多书，又练成了武功，从小就诅骂皇帝，说要推倒宋朝，立心要杀了皇帝与当朝大臣为岳爷爷跟太师祖报仇。那时秦桧早已死了，高宗年老昏庸。师父的父亲教他忠君事亲的圣贤之道，师父听了不服，不断跟师祖争论，家里都说他不孝，后来师祖一怒之下，将他赶了出家。他回到浙江西路，非但不应科举，还去打毁了庆元府明伦堂，在皇宫里以及宰相与兵部尚书的衙门外张贴大告示，在衢州南迁孔府门外张贴大告示，非圣毁贤，指斥朝廷的恶政，说该当图谋北伐，恢复故土。
原来神龙见首不见尾的黄老邪，现在变得根红苗正，愤怒爱国青年出身，敢于上首都贴大字报，公开议论国家大政方针，在成为通缉犯后，在江湖上闯下了一个“邪怪大侠”的名头。这样写，固然增加了黄药师的正义性，但同时也将其来历不明的神秘感破坏殆尽，不像以前那样对世俗世界有一种超然感。
