明清以前，由于没有统一的汉字注音方法，六字诀的读音主要靠已知之字音互切而说明。这样，就造成了人们对六字诀发音的歧义，出现了“同字不同音、同音不同字”的现象。
从现有文献来看，以“养气功六字诀”、“峨眉派”、“六字真言”的说法基本概括了六字诀的读音和口型的差异。
其中，“呵”字，“养气功六字诀”读“ｋē”，“峨眉派”读“ｈā（哈）”，“六字真言”读“ｈē”；“呬”字，“养气功六字诀”读“ｘｉà”，（？？？）“峨眉派”读“ｓī（嘶）”，而“六字真言”读“ｘì”，差异最大。
为此，课题组专门请教了我国有关音韵学专家。在了解六字读音的历史演变概况后，他们都认为，“呵”字，应都读“ｈē”。而对“”字，认识并不统一，有的专家认为，清代和现代都应读“ｓｉ”，或四声降调“四ｓì”，或一声平调“嘶ｓī”；有的专家则认为应读“ｘì（戏）”，四声降调。
为慎重起见，课题组又进一步查阅了清代江慎修所著《河洛精蕴》的有关论述。在其卷七中“图书为声音之源说”记载：“人之言出于喉，掉于舌，触击于牙、齿、唇，以应五行。喉音为土，舌音为火，牙音为木，齿音为金，唇音为水。” 其对发声部位解释与我国戏曲界专家所说相同。经深入分析研究发现，呼（ｈū）字正好为喉音，五行属土，对应脾；呵（ｈē）字正好为舌音，五行属火，对应心；嘘、嘻为牙音，五行属木，对应肝、胆；吹（ｃｈｕī）字正好为唇音，五行属水，对应肾。呬字读ｓī则正好为齿音，五行属金，对应肺。这些，恰恰形成了五行五音五脏的对应关系，符合传统中医理论。
由此，在“呬”字上，国家体育总局《健身气功六字决》课题组确定了ｓｉ的发音。至于声调，是根据六字诀调息法要求匀细柔长的规律确定为平声ｓì，与其他五字统一。六字都为清音平声。
六字的口型
在六字读音确定后，由于受地方口音的影响，仍会造成六字诀读音发声的差异。用现代普通话来规范和统一，不失为一种较好的方法。但用特定的口型与气息要求来规范六字诀的吐气发声，更能体现六字诀的内在本质。因为不同的口型会产生不同的内外气息，进而影响体内脏腑运动和经络运行状况。
“养气功六字诀”和“六字真言”都曾强调口型准确的重要性。“养气功六字诀”中讲：“脏腑的内部运动和经络的运行受人体内外不同作用力的影响，而呼气时用不同的口型可以使唇、舌、齿、喉产生不同的形状和位置，从而造成胸腔、腹腔不同的内在压力，影响不同的脏腑的气血运行，从而取得治病健身的效果。” “六字真言”中要求，吐字时要体会“着力点”：“口腔内不同部位的力发出不同的声音，这个部位就是着力点。着力点的规定不是要求练功者用力发音，而是要求练功者在练习中逐渐悟出这个点，自觉感受这个点，自然随和这个点，以保证发音的准确性和内脏和协共振。”
国家体育总局《健身气功六字决》课题组用以上唇齿舌喉牙、五行五音的系统原则对六字的口型与气息要点进行了规范化探索。
